三爺溪排水中下游河段治理工程奉經濟部於107年核定，由本署第四、六、七河川局及台南市政府等積極執行三爺溪中下游河道治理工作，預計111年底前可全數完成。目前已完成萬代橋至後壁厝排水口(一及二工區)，本河段經治理，於110年0806豪雨淹水面積僅約10公頃，相較103年0807豪雨淹水面積318公頃及105年梅姬颱風淹水面積250公頃，已大幅縮減淹水情形，顯示治理成效良好。